Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELK3P41970 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELK3P41970 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELK3P41970 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELK3P41970 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELK3P41970 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELK3P41970 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELK3P41970 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELK3P41970 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELK3P41970 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELK3P41970 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELK3P41970 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELK3P41970 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELK3P41970 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELK3P41970 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK3P41970 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms