Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5CP41229 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms