Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4AP40617 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms