Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFBP38117 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETFBP38117 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETFBP38117 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETFBP38117 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETFBP38117 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFBP38117 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFBP38117 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFBP38117 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFBP38117 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFBP38117 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFBP38117 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETFBP38117 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms