Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA4P35212 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA4P35212 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA4P35212 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA4P35212 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA4P35212 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA4P35212 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJA4P35212 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA4P35212 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA4P35212 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA4P35212 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms