Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms