Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC13P31276 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms