Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms