Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA5P30532 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA5P30532 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHRNA5P30532 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CHRNA5P30532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA5P30532 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA5P30532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms