Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMOD1P29536 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms