Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID4AP29374 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms