Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB2P29033 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB2P29033 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB2P29033 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB2P29033 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB2P29033 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB2P29033 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB2P29033 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB2P29033 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB2P29033 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB2P29033 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB2P29033 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms