Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms