Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO1P25800 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO1P25800 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO1P25800 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO1P25800 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO1P25800 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO1P25800 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms