Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA3P25788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms