Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms