Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3P25205 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3P25205 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3P25205 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3P25205 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3P25205 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3P25205 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCM3P25205 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCM3P25205 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCM3P25205 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCM3P25205 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCM3P25205 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms