Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA2P24043 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA2P24043 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms