Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPREP23469 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPREP23469 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPREP23469 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPREP23469 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPREP23469 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPREP23469 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
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