Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHBP21953 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCKDHBP21953 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms