Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms