Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms