Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT4P19013 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT4P19013 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT4P19013 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT4P19013 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT4P19013 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT4P19013 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT4P19013 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT4P19013 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT4P19013 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT4P19013 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms