Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGAM1P18669 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms