Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms