Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF3P15923 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF3P15923 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF3P15923 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF3P15923 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF3P15923 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF3P15923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms