Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VEGFAP15692 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms