Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRG2P13727 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRG2P13727 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRG2P13727 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRG2P13727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRG2P13727 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRG2P13727 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRG2P13727 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRG2P13727 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms