Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT13P13646 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT13P13646 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT13P13646 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT13P13646 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT13P13646 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT13P13646 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms