Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT10P13645 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT10P13645 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT10P13645 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT10P13645 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT10P13645 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT10P13645 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT10P13645 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT10P13645 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT10P13645 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT10P13645 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT10P13645 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT10P13645 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT10P13645 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT10P13645 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms