Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms