Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RLBP1P12271 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms