Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COL6A2P12110 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms