Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB1P11230 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB1P11230 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms