Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP10827 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP10827 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP10827 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP10827 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THRAP10827 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRAP10827 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRAP10827 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRAP10827 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRAP10827 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRAP10827 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRAP10827 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRAP10827 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRAP10827 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRAP10827 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms