Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARAP10276 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARAP10276 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARAP10276 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARAP10276 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARAP10276 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARAP10276 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARAP10276 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARAP10276 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARAP10276 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARAP10276 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARAP10276 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARAP10276 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARAP10276 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARAP10276 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARAP10276 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms