Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30-5P0DP03 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms