Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2CP0DJJ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms