Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGA3P0DJD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms