Protein–RNA interactions for Protein: P0CX35

RPS4A, 40S ribosomal protein S4-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS4AP0CX35 CBP4YGR174C 513 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SVP26YHR181W 687 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YPT52YKR014C 705 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TFS1YLR178C 660 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SAM37YMR060C 984 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 LST8YNL006W 912 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 MEI5YPL121C 669 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 IMA3YIL172C 1770 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 IMA4YJL221C 1770 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TBF1YPL128C 1689 nt5.46□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 MCM6YGL201C 3054 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YGL176CYGL176C 1665 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 PRP18YGR006W 756 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 IKI1YHR187W 930 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 PAN6YIL145C 930 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 MRP17YKL003C 396 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SFT1YKL006C-A 294 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YLR444CYLR444C 303 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RNA1YMR235C 1224 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 MCA1YOR197W 1299 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 CPA1YOR303W 1236 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SHE3YBR130C 1278 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TDA6YPR157W 1404 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RSC30YHR056C 2652 nt5.45□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SSK1YLR006C 2139 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SDA1YGR245C 2304 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YJR011CYJR011C 786 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YLR217WYLR217W 324 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ELO3YLR372W 1038 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 COS1YNL336W 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TRM10YOL093W 882 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 CWC27YPL064C 906 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ALG14YBR070C 714 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 snR3snR3 194 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 EKI1YDR147W 1605 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YMR155WYMR155W 1644 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ZRC1YMR243C 1329 nt5.44□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 KRE29YER038C 1395 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ERP3YDL018C 678 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RSM10YDR041W 612 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YDR154CYDR154C 351 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SNO3YFL060C 669 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YGL072CYGL072C 360 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YGL138CYGL138C 1038 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 LYS5YGL154C 819 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YGR022CYGR022C 330 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RPR2YIR015W 435 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SSO2YMR183C 888 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SNO2YNL334C 669 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TNA1YGR260W 1605 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 MIC60YKR016W 1623 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TKL1YPR074C 2043 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 NOC4YPR144C 1659 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 PRT1YOR361C 2292 nt5.43□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SAC6YDR129C 1929 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YIL067CYIL067C 2037 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 DTD1YDL219W 453 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YLR462WYLR462W 609 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RHO2YNL090W 579 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RPS15YOL040C 429 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 CUE5YOR042W 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ATG5YPL149W 885 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YPR202WYPR202W 717 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TRP3YKL211C 1455 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 QNS1YHR074W 2145 nt5.42□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 AI4Q0065 1671 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 VPS30YPL120W 1674 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 TIP20YGL145W 2106 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 PCL8YPL219W 1479 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 UBC1YDR177W 648 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 CYC1YJR048W 330 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YKL023WYKL023W 834 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 DCN1YLR128W 810 nt5.41□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 IDS2YJL146W 1410 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 NGR1YBR212W 2019 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 GEX1YCL073C 1848 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 GEX2YKR106W 1848 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 YDR018CYDR018C 1191 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 GRX3YDR098C 858 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 BUD25YER014C-A 462 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 EPS1YIL005W 2106 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 HIS6YIL020C 786 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 ARC15YIL062C 465 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 IRC21YMR073C 606 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 RCN2YOR220W 798 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 PRM3YPL192C 402 nt5.4□□□□□ -1.54
RPS4AP0CX35 SET5YHR207C 1581 nt5.4□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 SFB3YHR098C 2790 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 NOP8YOL144W 1455 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 RCR2YDR003W 633 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 YDR248CYDR248C 582 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 SNX4YJL036W 1272 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 POM33YLL023C 840 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 PAU17YLL025W 375 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 IRC19YLL033W 693 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 ECI1YLR284C 843 nt5.39□□□□□ -1.55
RPS4AP0CX35 CPR3YML078W 549 nt5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms