Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM228BP0C875 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms