Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CT47B1P0C2W7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CT47B1P0C2W7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
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