Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPAP09012 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPAP09012 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPAP09012 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms