Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSP90AB1P08238 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HSP90AB1P08238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms