Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF1RP07333 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF1RP07333 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms