Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC2P02655 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC2P02655 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC2P02655 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC2P02655 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOC2P02655 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC2P02655 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC2P02655 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC2P02655 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC2P02655 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC2P02655 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms