Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA2P02652 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOA2P02652 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOA2P02652 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA2P02652 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA2P02652 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA2P02652 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms