Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIMP1P01033 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms