Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NSD2O96028 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NSD2O96028 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD2O96028 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD2O96028 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD2O96028 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD2O96028 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD2O96028 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD2O96028 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD2O96028 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD2O96028 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD2O96028 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD2O96028 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD2O96028 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD2O96028 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD2O96028 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD2O96028 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD2O96028 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD2O96028 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD2O96028 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms