Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APBA3O96018 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APBA3O96018 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APBA3O96018 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
APBA3O96018 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
APBA3O96018 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APBA3O96018 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA3O96018 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA3O96018 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA3O96018 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APBA3O96018 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APBA3O96018 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms